Чи можна перерву перенести на кінець робочого дня?

Теоретично - цілком таке можливо. При цьому треба узгодити це з керівництвом. І підписати Додаткову угоду з Трудовому договору.

Але не думаю, що ваше керівництво сильно зрадіє вашій ідеї. Адже все одно ви будете обідати на роботі.